副教授

黄胜雄

发布日期:2016-06-23

 

副教授 硕士研究生导师

(1)个人简介

主要研究方向为番茄、猕猴桃为代表的植物功能基因组学与代谢组学,发掘阐述涉及其中的主要转录因子基因及其调控网络。2013年,以第一作者身份(共同第一作者,排名第一),在《Nature Communications》发表了中华猕猴桃“红阳”的全基因组测序论文。该论文揭示了中华猕猴桃基因组编码的39,040个基因,阐述了中华猕猴桃基因组进化过程中的三次倍增事件,以及中华猕猴桃果实风味形成的分子机制。该研究工作为中华猕猴桃的深入研究提供了坚实的数据基础和信息平台。番茄研究工作中,主要以类胡萝卜素生物合成调控途径的主要基因进行发掘和功能探究。

(2)教育经历

2008.9 - 2012.6 四川大学,生命科学学院,博士

(3)工作经历

2012.9 - 至今 合肥工业大学,食品科学与工程学院,副教授

(4)科研论文(†同等贡献,*通讯作者)

1.     Huang S†, Ding J†, Deng D†, Tang W†, Sun H†, Liu D†, Zhang L†, Niu X,     Zhang X, Meng M, Yu J, Liu J, Han Y, Shi W, Zhang D, Cao S, Wei Z, Cui Y, Xia Y, Zeng H,  Bao K, Lin L, Min Y, Zhang H, Miao M, Tang X, Zhu Y, Sui Y, Li G, Yue J, Sun J, Liu F, Zhou L, Lei L, Zheng X, Liu M, Huang L, Song J, Xu C, Li J, Ye K, Zhong S, Lu BR, He G, Xiao F,  Wang HL, Zheng H*, Fei Z*, Liu Y* (2013) Draft genome of the kiwifruit Actinidia chinensis. Nature Communications 4: 2640

2.    Zhu Y†, Huang S†*, Miao M, Tang X, Yue J, Wang W, Liu Y* (2015) Genome-wide identification, sequence characterization, and protein-protein interaction properties of DDB1 (damaged DNA binding protein-1)-binding WD40-repeat family members in Solanum lycopersicum. Planta 241(6): 1337-1350

3.     Huang S†, Gao Y†, Liu J, Peng X, Niu X, Fei Z, Cao S*, Liu Y* (2012) Genome-wide analysis of WRKY transcription factors in Solanum lycopersicum. Molecular Genetics and Genomics 287(6): 495-513

4.    Tang X†, Tang Z†, Huang S†, Liu J†, Shi W, Tian X, Li Y, Zhang D, Yang J, Gao Y, Zeng D, Hou P, Niu X, Cao Y, Li G, Li X*, Xiao F, Liu Y* (2013) Whole transcriptome sequencing reveals genes involved in plastid/chloroplast division and development are regulated by the HP1/DDB1 at an early stage of tomato fruit development. Planta 238(5): 923-936

5.    Tang W†, Zheng Y†, Dong J, Yu J, Yue J, Liu F, Guo X, Huang S, Wisniewski M, Sun J, Niu X, Ding J, Liu J*, Fei Z, Liu Y* (2016) Comprehensive transcriptome profiling reveals long noncoding RNA expression and alternative splicing regulation during fruit development and ripening in kiwifruit (Actinidia chinensis). Frontiers in Plant Science 7:335

6.    Li Y†, Deng H†, Miao M†, Li H, Huang S, Wang S, Liu Y* (2016) Tomato MBD5, a methyl CpG binding domain protein, physically interacting with UV-damaged DNA binding protein-1, functions in multiple processes. New Phytologist 210(1): 208-226

7.    Yue J†, Xu W†, Ban R†, Huang S, Miao M, Tang X, Liu G, Liu Y* (2016) PTIR: Predicted tomato interactome resource. Scientific Reports 6:25047

8.    Tang X†, Liu J†, Huang S, Shi W, Miao M, Tang DF, Niu X, Xiao F*, Liu Y* (2012) Roles of UV-damaged DNA binding protein 1 (DDB1) in epigenetically modifying multiple traits of agronomic importance in tomato. Plant Signaling & Behaviour 7(12): 1529-1532

9.    Liu J†, Tang X†, Gao L†, Gao Y, Li Y, Huang S, Sun X, Miao M, Zeng H, Tian X, Niu X, Zheng L, Giovannoni J, Xiao F*, Liu Y* (2012) A role of tomato UV-damaged DNA binding protein 1 (DDB1) in organ size control via an epigenetic manner. PLoS One 7(8): e42621

10.   朱芸晔, 薛冰, 王安全, 王文杰, 周昂, 黄胜雄*, 刘永胜 (2014) 番茄bZIP转录因子家族的生物信息学分析. 应用与环境生物学报 20(5): 767-774

11.   黄胜雄, 刘永胜* (2013) 土豆 WRKY 转录因子家族的生物信息学分析. 应用与环境生物学报 19(2): 205-214

12.   孟蒙, 唐维, 刘嘉, 黄胜雄, 余进德, 刘方方, 林琳, 张霞, 刘永胜* (2014) 基于中华猕猴桃“红阳”转录组序列开发EST-SSR分子标记. 应用与环境生物学报 20(4): 564-570

(5)科研项目

主持国家自然科学基金青年项目一项;

项目名称:中华猕猴桃类胡萝卜素生物合成调控因子的发掘和功能解析。

(6)联系方式

huang_shenghsiung@163.com